Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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