Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN1P49257 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms