Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSOP43234 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSOP43234 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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