Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMPOP42166 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMPOP42166 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMPOP42166 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms