Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms