Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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APOBEC3AP31941 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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APOBEC3AP31941 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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APOBEC3AP31941 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC3AP31941 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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