Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms