Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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