Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD1P28340 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD1P28340 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLD1P28340 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms