Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA1P17302 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA1P17302 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA1P17302 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA1P17302 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA1P17302 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA1P17302 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA1P17302 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA1P17302 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA1P17302 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA1P17302 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA1P17302 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms