Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC025437.4-201ENST00000522975 681 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms