Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms