Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNAP02545 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNAP02545 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNAP02545 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNAP02545 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNAP02545 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNAP02545 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNAP02545 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNAP02545 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNAP02545 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms