Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFL1O94874 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFL1O94874 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFL1O94874 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFL1O94874 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFL1O94874 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFL1O94874 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFL1O94874 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFL1O94874 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFL1O94874 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UFL1O94874 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFL1O94874 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFL1O94874 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFL1O94874 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFL1O94874 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFL1O94874 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFL1O94874 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFL1O94874 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFL1O94874 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFL1O94874 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFL1O94874 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFL1O94874 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms