Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TRIM38O00635 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TRIM38O00635 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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