Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3B1O00203 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms