Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms