Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9PBE3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E9PBE3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms