Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms