Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms