Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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POMPQ9Y244 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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POMPQ9Y244 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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POMPQ9Y244 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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POMPQ9Y244 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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POMPQ9Y244 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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POMPQ9Y244 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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