Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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KLHL13Q9P2N7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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KLHL13Q9P2N7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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KLHL13Q9P2N7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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KLHL13Q9P2N7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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KLHL13Q9P2N7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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KLHL13Q9P2N7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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KLHL13Q9P2N7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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KLHL13Q9P2N7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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KLHL13Q9P2N7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL13Q9P2N7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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