Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TMEM248Q9NWD8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TMEM248Q9NWD8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TMEM248Q9NWD8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TMEM248Q9NWD8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TMEM248Q9NWD8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TMEM248Q9NWD8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TMEM248Q9NWD8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TMEM248Q9NWD8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TMEM248Q9NWD8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TMEM248Q9NWD8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TMEM248Q9NWD8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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