Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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