Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms