Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms