Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TREX2Q9BQ50 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms