Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC114Q96M63 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms