Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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SAMD8Q96LT4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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SAMD8Q96LT4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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SAMD8Q96LT4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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SAMD8Q96LT4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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SAMD8Q96LT4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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SAMD8Q96LT4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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SAMD8Q96LT4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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SAMD8Q96LT4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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SAMD8Q96LT4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SAMD8Q96LT4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SAMD8Q96LT4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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