Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms