Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms