Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ATG4AQ8WYN0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ATG4AQ8WYN0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4AQ8WYN0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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