Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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