Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms