Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms