Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms