Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LRRC38Q5VT99 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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LRRC38Q5VT99 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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LRRC38Q5VT99 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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LRRC38Q5VT99 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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LRRC38Q5VT99 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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LRRC38Q5VT99 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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LRRC38Q5VT99 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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LRRC38Q5VT99 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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