Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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