Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms