Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms