Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms