Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms