Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CTF1Q16619 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CTF1Q16619 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CTF1Q16619 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CTF1Q16619 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CTF1Q16619 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CTF1Q16619 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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