Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CSRP2Q16527 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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