Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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CHD4Q14839 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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CHD4Q14839 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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CHD4Q14839 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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CHD4Q14839 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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CHD4Q14839 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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CHD4Q14839 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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CHD4Q14839 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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CHD4Q14839 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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