Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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