Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
APOFQ13790 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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