Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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