Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NAE1Q13564 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NAE1Q13564 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NAE1Q13564 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NAE1Q13564 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NAE1Q13564 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NAE1Q13564 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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NAE1Q13564 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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