Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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